电商公司的税务稽查时间主要取决于多个因素，包括案件的复杂程度、纳税人的合作程度、是否存在需要延长的特殊情况等。根据现有的规定和实际情况，税务稽查的时间可以从 60天到90天不等。
基本程序时间
税务查账通常需要60天左右。检查部门在实施检查后60日内完成检查并制作《税务稽查报告》，若需延长，需经稽查局局长批准。
审理阶段，检查部门在5个工作日内将材料移交审理部门，审理部门接到材料后15日内提出审理意见，案情复杂可延长，但总时间不超过90日。
综合考虑时间
税务稽查从立案到处罚通常需要3-6个月的时间，这个时间限制包括了调查、报告、听证和处罚等各个环节。
特殊情况
如果纳税人的历史记录良好且资料齐全真实，税务稽查可能只需要1-2天。
若纳税人存在大量税收避税行为或资料不准确，税务稽查可能需要数周甚至更长时间。
法律依据
《税务稽查工作规程》和《税务稽查案件办理程序规定》对税务稽查的时间有明确规定，总时间通常不超过90日，特殊情况下可经上级税务局批准延长。
建议
提前准备：纳税人应提前准备好所有相关财务和税务资料，确保资料的真实性和完整性，以减少检查时间。
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